ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАЦИОНАЛЬНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР АКУШЕРСТВА, ГИНЕКОЛОГИИИ ПЕРИНАТОЛОГИИ
имени академика В.И. Кулакова
Министерства здравоохранения Российской Федерации

VolcanoR

веб-сервис для анализа результатов дифференциальной экспрессии генов

Возможности:

  • гененрация графиков volcano публикационного качества
  • настройка параметров - пограничных значений p-value и fold change
  • проведение анализа обогащения метаболичесикх путей:
    • KEGG
    • GeneOntology biological process

В качестве входных данных используется txt файл с результатами диференциальной экспрессии

Примеры работы:

Запустить VolcanoR

Для цитирования используйте публикацию на bioRXiv: VolcanoR - web service to produce volcano plots and do basic enrichment analysis

Для установки локальной версии - воспользуйтесь gitHub : https://github.com/vovalive/volcanoR